Esta iglesia muestra varias fases constructivas entre los siglos XVI y XVIII, terminándose en el año 1928. Se empezó a construir en el s. XVI por Andrés de Vandelvira responsable según todas las fuentes del trazado de la iglesia. Luego parece que las obras se interrumpieron en 1575, posiblemente por la muerte del arquitecto. Las obras se volvieron a emprender en 1614 por iniciativa del cardenal Baltasar Moscoso.
Es de estilo renacentista andaluz, de la escuela de Vandelvira. La torre y el sotocoro los edificó Eufrasio López de Rojas. En su largo proceso constructivo intervinieron los grandes maestros que en esas fechas trabajaban en la provincia: Andrés de Vandelvira, Juan de Aranda, Eufrasio López de Rojas y Ventura Rodríguez. El interior es de planta de salón con tres naves, cubierta la central con bóvedas semiesféricas y baídas las laterales. Las pinturas al fresco en la bóveda izquierda del crucero (siglos XVI-XVII) se reconocen San Esteban, San Sebastián, San Lorezno, San Antonio, San Nicolás, San Lucas y Santa Águeda. 
La reorganización del espacio interno la planteó Juan de Aranda, construida en el siglo XVII, diseñando un coro en alto para aprovechar el amplio hueco que quedaba entre los estribos, también realizó la Portada principal: Manierista tanto en su concepto como en ornamentación, labrada en piedra y estructurada a modo de retablo. Sus elementos más llamativos son el arco de medio punto que abre la puerta, las dobles columnas que la flanquean, los motivos ornamentales como punta de diamante o los estructurales como pilastras y frontones partidos semicirculares.
A partir de 1670 López de Rojas obró el coro, cubrió el sotocoro con bóvedas de cañón con lunetos y trazó la torre, otro de los referentes destacados del templo. Su base cuadrangular y primer cuerpo, carente de decoración, lo apuntalan fuertes estribos. En 1775 se haría cargo de levantar el segundo cuerpo de la torre, Ventura Rodriguez. Bóveda del crucero, con pinturas que representan a los Evangelistas y a los Padres de la Iglesia, y una inscripción que reza: "Acabóse año de mil seiscientos veintiocho, siendo Sumo Pontífice Urbano VIII, reinando Filipo IV, siendo Obispo de Jaén el Cardenal Sandobal i Moscoso, prior el Doctor Martín Láñez Dávila y obrero El Mº Antonio Cobos"
Se conserva un fragmento del retablo original del altar mayor (siglo XVII) de Gil Fernández y Diego de Landeras, en la sacristía.
Fue declarada Monumento Histórico en 1983

El proyecto lo realiza D. Manuel Sancho Sánchez, maestro de cantería, encargando la construcción a un gran albañil llamado D. Benito el Santo. Se establecen las condiciones entre las que destacan la realización de dos danzas de arcos para separación de las tres naves del templo, teniendo cada danza tres arcos, resultando un total de nueve tramos. La portada principal y la torre campanario quedó a cargo del maestro de cantería D. Manuel Sancho Sánchez. La construcción de la iglesia debió terminarse de forma provisional para poder celebrar los Santos Oficios. En 1618 se construye el Retablo Mayor, es destruido en la Guerra Civil Española, ocupaba todo el testero del presbiterio levantado sobre pedestal con relieves en dos pisos muy elevados, estaba rematado con un ático terminado en frontón roto con tímpano donde estaba la figura del Padre Eterno sosteniendo en su diestra la esfera del mundo.

Ambos pisos y el ático marcaban tres calles, siendo la central más ancha que las laterales y separadas con columnas corintias pareadas y adelantadas sobre el plano general del retablo. En las calles laterales se enmarcaban relieves con escenas de la vida de Jesucristo y de la Virgen. La calle central la ocupaba un gran Sagrario-manifestador en el segundo piso, un relieve con el misterio de la Encarnación. El ático lo presidía un calvario con figuras de Cristo Crucificado, la Virgen Ruinas de un pasado glorioso en y San Juan. La figura del Padre Eterno, cerraba todo el conjunto que además contaba con esculturas de Santos sobre los capiteles y cornisas. Las calles laterales se remataban con escudos del Obispo D. Baltasar de Moscoso y Sandoval que rigió la Diócesis en 1618. Su estilo era renacentista de transición al Barroco, y estaba decorado con elementos propios de la época, pero sin demasiados adornos. El presbiterio se completaba en sus paredes laterales, con dos grandes cuadros pintados al óleo.

El órgano se colocó en el coro a mediados del XVIII. Las campanas se instalaron en 1858. En la fachada de la torre que da a la plaza principal y bajo la campana mayor, si instaló en 1906, un reloj de época con esfera en números romanos, costeado por la Junta de reparación del templo y cedido al Ayuntamiento para su conservación; es del denominado "sistema redondo" con péndulo compensador. Fue adquirido a D. Lorenzo Redondo, vecino de Cuenca.

Disponía de martillo que daba las horas en la campana. En la década de los 80, se anuló la maquinaria del reloj y se colocó un dispositivo electrónico en su lugar para seguir marcando las horas y las campanadas. En 1996, se retira la antigua maquinaria, se restaura y actualmente se encuentra en un expositor en el Salón de Plenos del Ayuntamiento.

Al frente de las obras en esta fase constructiva estuvieron Francisco del Castillo “El Viejo” y Domingo de Tolosa. En 1547 Andrés de Vandelvira y Juan de Maeda tasaron las obras ejecutadas por Castillo y Domingo de Tolosa, centradas fundamentalmente en el levantamiento de la capilla mayor y el primer tramo del templo. Es la primera noticia documentada sobre la intervención de Andrés de Vandelvira en esta iglesia, cuyo planteamiento inicial será cambiado por este maestro hacia 1559. Los cambios introducidos por Vandelvira afectaron a los tramos restantes: se igualan las naves en anchura y altura, entre los contrafuertes se sitúan capillas, las nervaduras iniciales de las bóvedas se cambian por baídas, los pilares, con semicolumnas y retropilastras corintias, son ahora cruciformes y con una modulación más clásica, a semejanza de los empleados en las catedrales de Baeza y Jaén.

Los trabajos a pie de obra estuvieron, entre otros maestros, bajo la dirección de Castillo “El Viejo”, pero en 1564 el contrato que este maestro cantero tenía suscrito con la iglesia fue traspasado a su hijo Francisco del Castillo “el Joven”, relacionado desde 1555 con la construcción. Castillo “El Joven” siguió las directrices marcadas por Vandelvira, el cual visitó Huelma en 1569 y 1570 para tasar las obras. En 1575, año de la muerte de Andrés de Vandelvira, la fábrica estaba bastante avanzada, pero quedaban por terminar algunas bóvedas y los exteriores con las portadas, la sacristía y la torre de campanas. Ahora figura como maestro mayor de la fábrica Francisco del Castillo “El Joven”, que estará al frente de la misma hasta su muerte en 1586. Bajo su supervisión se labraron la bóveda central, con un programa escultórico finalizado por Marcos Hernández en 1584, y otras cinco decoradas con motivos geométricos propios del manierismo, destacando la tercera decorada además con las armas del prelado giennense Francisco Sarmiento de Mendoza (1580-1595).

Las tres últimas bóvedas ya no son de piedra, sino de ladrillo, y fueron rematadas después de la muerte de Castillo junto con la sacristía, cuya disposición en “L” nos recuerda la solución planteada por Vandelvira en las dependencias de la catedral de Jaén. Los exteriores, obra de Castillo “el Joven”, presentan uno de los alzados más elegantes construidos en el siglo XVI dentro de la arquitectura religiosa andaluza. Castillo “El Joven” introduce en estos exteriores modelos de la arquitectura civil tomados de los tratados de arquitectura de Sebastián Serlio. El ritmo de este alzado está marcado por las pilastras corintias colocadas en los dos pisos, por los ventanales adintelados con frontones triangulares y por la portada, destacando la del sur, igualmente adintelada y coronada por gran frontón triangular y flanqueada con hornacinas. Heráldica, mascarones, guirnaldas, molduradas cornisas y otros elementos del repertorio manierista completan la belleza del conjunto, finalmente ultimado ya dentro del siglo XVII con una gran torre de campanas, en cuyo segundo cuerpo luce el escudo del obispo Moscoso y Sandoval (1619-1646). El templo de Huelma -como apunta Rafael López Guzmán- “muestra perfectamente la evolución estética que se produce en el Reino de Jaén durante el siglo XVI; además de contar, en su realización, con los maestros más sobresalientes del momento”.

OTRAS MANIFESTACIONES ARTÍSTICAS NO ARQUITECTÓNICAS

Del importante conjunto de bienes muebles que este magnífico templo fue adquiriendo a lo largo de los siglos, apenas queda nada, pues fueron totalmente destruidos en la pasada Guerra Civil (1936-1939). Sabemos documentalmente que en la capilla mayor había un buen retablo trazado a fines del siglo XVI por Sebastián de Solís, que contó con la colaboración del escultor Cristóbal Téllez y del ensamblador Blas Briñón. Hoy dicha capilla luce un retablo pintado por Juan Almagro (Pegalajar, 1886-1965), siendo de mérito una talla de un Resucitado. De cierto valor es un lienzo de escuela granadina de la Inmaculada Concepción, obra anónima del último tercio del siglo XVII.

La hermosa torre es obra de Juan de Aranda (1640) decorada con escudos episcopales. La portada es neoclásica de fines del XVIII obra de Manuel Caballero, una de las mejores de la provincia por sus airosas proporciones. Empotrada en el muro, se halla la valiosa 'inscripción Ibero-latina de Galdur' ciudad cuna antigua de Jódar, del siglo I. d. C. Esta práctica servía para enaltecer la antigüedad clásica, donde este estilo arquitectónico encontraba sus raíces.

Historia

Fue construida sobre la primitiva Mezquita, documentada por el geógrafo árabe Al-Himyari, el cual menciona que era de “tres naves sostenidas por columnas de mármol”.

Su primitiva advocación era la de Santa María, desconociéndose cómo era el edificio primitivo solo que el Altar Mayor estaba orientado al oeste y su puerta principal al norte, junto a la denominada “Fuente del Lugar”. Los primeros datos documentales sobre las obras del actual templo se remontan al año 1547, trayendo la piedra de la cantera de Bedmar. En 1569 trabajaba en ella el Maestro Domingo de Uriarte. De 1582 a 1589 la obra estuvo a cargo de Juan Vizcaino. En 1591 se menciona como constructores y maestros canteros a los hermanos Gaspar y Francisco de Aranda, construyéndose la nave central con sus seis capillas laterales con bóvedas de casetones, tan al uso de Vandelvira, que era el supervisor de las obras de los templos de la Diócesis. Todo el conjunto construido es de estilo renacentista-purista.

En 1613 se comienza la construcción de la Torre, según traza de Juan de Aranda Salazar con un estilo barroco. En la misma se encuentran labrados en piedra tres escudos pertenecientes a los Obispos: Sancho Dávila, Cardenal Moscoso y Fernando Andrade, interviniendo en la obra los Maestros Francisco de Zamora, Alonso Galan, Andrés y Diego Guerrero, siendo terminada en 1661 por Eufrasio López de Rojas, encontrándose en su interior un escudo de Sancho Dávila. Una de sus cuatro campanas es de 1794.

En 1729 se repara la cabecera o Capilla Mayor por Juan de Consuegra. De 1771 a 1780 se construye el actual crucero, Capilla Mayor y cúpula de los Evangelistas en estilo neoclásico con detalles del rococó en la cúpula que fue construida por Pedro Fernández, Manuel y Juan Armenteros. En 1799 se colocan los púlpitos y graderías iniciándose la construcción de la Fachada Principal en estilo neoclásico por Manuel Caballero que la termina, junto con el coro en 1801. Según algunos historiadores la fachada es una de las mejores de la provincia por sus airosas proporciones. En 1864 se construyen las Capillas de La Expiración y la Bautismal. En 1877 finalizan los trabajos de construcción de la Capilla de San José, dirigida por el Arquitecto Pedro Pascual Samaniego, con elegante media naranja, que se encuentra decorada con interesantes frescos de 1915. De 1989 a 1992 el templo sufrió una profunda restauración añadiéndole elementos que realzan aún más su interior como varios retablos en mármol de Macael y piedra, la magnífica Reja y sillería de la Capilla de San José, iluminación, etc.

Desde 2013 la Asociación Eco cultural Huerto de la Cora, cuenta con el reconocimiento institucional y con la cesión de los terrenos por acuerdo unánime de todos los grupos políticos del Ayuntamiento de Jódar.

Todo en el Huerto de la Cora tiene un porqué, una historia que pasa desapercibida a ojos del visitante. Es preciso descifrar el significado de cada componente o habitante de este espacio para entender el verdadero valor de lo que encierran las paredes de este antiguo colegio, que pese no estar ocupado por las risas y juegos de los niños, sigue siendo sinónimo de vida y de futuro.

Gracias al trabajo de los miembros de la Asociación Eco cultural del Huerto de la Cora, aquí se mantiene una verdadera actividad de laboratorio; de recuperación y conservación de semillas locales –o de otras provincias– en riesgo de extinción así como el cultivo de ejemplares de otras zonas del planeta que se consideran especialmente interesantes basándonos en las condiciones climáticas de la zona.