Probablemente las obras se iniciaron bajo el mandato del prelado don Esteban Gabriel y Merino (1523-1535); durante el período que estuvo al frente de la Diócesis se labraron una serie de portadas con su heráldica, asociadas a templos góticos, en las que se introducen los nuevos estilemas del protorrenacimiento o plateresco. En Santa María, y adscritas a este estilo, se conservan dos interesantes portadas con el escudo de Merino, que tradicionalmente han sido atribuidas a Diego de Alcaraz, importante cantero activo en la Loma de Úbeda durante la primera mitad del siglo XVI.

El proceso constructivo de este templo no concluyó con el obispo Merino, sino que se alargó durante gran parte del dicho siglo. Andrés de Vandelvira, maestro mayor de la Catedral de Jaén desde 1553, tenía también la obligación de revisar, tasar o dar diseños para las obras proyectadas por la diócesis. En Santa María intervino en dos ocasiones, según V. M. Ruiz Fuentes; el 15 de septiembre de 1570 para dar las trazas para la capilla fundada por Dª. Marina Ortega, situada junto a la torre; en 1571 dictaba las condiciones para finalizar la torre de campanas, encargándose de la obra el cantero local Diego de Ávila.

De la capilla solo queda la portada, con sencillo arco de medio punto, con espejos en las enjutas, flanqueado por pilastras cajeadas y rematada con una cornisa moldurada. De la torre es original el primer cuerpo, siendo el resto fruto de una reconstrucción de mediados del pasado siglo XX.

En el lado de la Epístola se abre una monumental capilla, que según G. Torres Navarrete fue costeada por Alonso del Villar y su mujer María Ximénez. Arquitectónicamente responde a una composición vandelviriana, conformada por un gran arco triunfal de medio punto, con figuras de ángeles recostados en las enjutas, apeado en pilastras acanaladas dobles y clave resaltada y apergaminada, enmarcado a los extremos por semicolumnas corintias y retropilastras cajeadas, con los típicos bastoncillos alternantes usados por el Maestro; elevadas sobre basamentos sobre las que apea un entablamento decorado con tacos en la cornisa, en la que se alza en el centro una hornacina de molduración clásica con una imagen de María con el Niño, a los extremos San Juan Evangelista y otra imagen femenina; el interior se cubre con una delicada bóveda de medio cañón acasetonada decorada con rosetas.

Dentro de la producción de Andrés de Vandelvira se ha incluido tradicionalmente el retablo pétreo del Descendimiento de la Cruz que, aunque mutilado, se conserva en el lado de la Epístola. Se trata de una capilla enterramiento fundada por fray Miguel de Síles Martínez, Comendador de Alcántara y prior del convento de Santo Domingo de la misma ciudad, en opinión de G. Torres Navarrete.

En 1571, fecha de la fundación de una capellanía en dicho enterramiento, el conjunto probablemente quedó concluido. A los escultores Luis de Aguilar o Juan de Reolid se han atribuido las labores escultóricas: el bello relieve del Descendimiento (mutilado parcialmente), las cuatro esculturas desaparecidas de San Pedro, San Pablo, San Benito y Santo Domingo de las hornacinas laterales y el Cristo crucificado, sostenido por dos ángeles, con el que se remata este singular retablo funerario renacentista.

OTRAS MANIFESTACIONES ARTÍSTICAS NO ARQUITECTÓNICAS

La Capilla Mayor de Santa María se embelleció con dos grandes intervenciones proyectadas en el siglo XVI, que aún lucen en ella. Su bóveda gótica fue decorada con un programa pictórico basado en Virtudes insertas en tondos y diversos motivos imitando mármoles, todo ello realizado al temple sobre yeso.

El retablo mayor, conformado por tres calles, dos pisos y ático, ha llegado a nuestros días un tanto retocados, pero conserva gran parte de su original estructura labrada durante los siglos XVI y XVII, dorándose en el siglo XVIII por el pintor ubetense José García de Espantaleón.

En la sacristía son de bella factura la cajonería y mesa de mármol (S. XVIII). De su imaginería son destacables el Cristo Yacente (S. XX), de Víctor de los Ríos, y un Crucificado (S. XX), de Francisco Palma Burgos.

Construida en mampostería revocada y pintada, su sencilla fachada, de reducidas dimensiones, habla un lenguaje clasicista: una ligera escalinata enfatiza la puerta de acceso, compuesta por un arco de medio punto sobre impostas, flanqueado por pilastras toscanas, que dan paso a un entablamento terminado en un frontón triangular con óculos a cada uno de sus lados. Sobre la cornisa de este primer cuerpo se alza una airosa espadaña, de estructura piramidal en tres niveles, con pinaculillos en los extremos y huecos de medio punto para campanas. La espada subraya su jerarquía convirtiéndola en el edificio más alto de la plaza. 

En su interior presenta una sola nave de cajón, cubierta con bóveda de medio cañón y lunetos dobles a los lados. El presbiterio se abre con un arco toral y también se observan hornacinas formadas por columnas toscanas, entablamento y frontón triangular. Este espacio se cubre con bóveda de aristas y se ilumina con dos grandes ventanales en forma de óculos. La cabecera la preside la imagen escultórica de la patrona, Santa Elena, entre columnas dóricas que soportan un entablamento y un frontón curvo.

La ausencia de autonomía política, la inexistencia de una nobleza o burguesía local, y la falta de recursos económicos, hizo que el proyecto de levantar una iglesia parroquial consagrada a San Pedro ad Víncula se fuera postergando hasta bien entrado el siglo XIX y necesitara remodelaciones todavía a finales del XX.

La iglesia se levantó sobre una vieja ermita y el antiguo cementerio, situado junto a ella. Fue a partir de la década de 1860-70 cuando se impulsaron las obras del templo siguiendo el proyecto de Vicente Serrano y de cuya ejecución se ocuparía José María de Cuenca.

Consta de una sola nave, articulada por tramos, con cabecera curva y planta irregular por la anexión de espacios para capillas en el lateral del Evangelio. Cercano a los pies se encuentra el coro y, simétricamente diseñadas, dos escaleras de caracol. Se cubre con teja árabe a dos aguas y presenta una altura menor incluso que la de las casas que tiene anexionadas.

Su actual portada no se ajusta a la trazada en 1860, que presentaba un aire pseudo clasicista, un estrecho hueco de entrada y un frontón que nacía de la línea del tejado; se cambió por una entrada adintelada más sencilla, funcional y de menor empaque. La torre, ubicada en un lateral del presbiterio, presenta una estructura cuadrada en la que también se ha sustituido su chapitel inicial por una esbelta linterna que le da un aire un tanto exótico. La fachada, encalada, está reforzada por pequeños contrafuertes. En 1993 Luis Alonso Salcedo restauró la torre dándole el aire ecléctico que actualmente presenta y dirigió asimismo las obras del presbiterio y de la capilla de la Virgen de los Remedios.

La iglesia, a pesar de sus generosas dimensiones, se organizó a partir de una sola nave, dividida en dos tramos, con cubierta de bóveda de medio cañón que descarga sobre arcos fajones. En su exterior se observa un aire neo clasicista. La portada principal es de cantería. La torre, de aspecto achatado, se añadió posteriormente.

Según F. Escolano Gómez, el 14 de mayo de 1565, Pedro Hernández de Baeza, prior de la iglesia parroquial de San Andrés, rinde cuentas por mandato del obispo Diego de los Cobos, del cargo y descargo de la fábrica de los años 1562 a 1564; en el descargo del año 1564 se le pagan a Andrés de Vandelvira 3.740 maravedís “(...) por la traça de la capilla mayor que hizo (...)”; consta además que la fábrica se prosiguió entre los años 1565 a 1570 y que en 1572 Alonso Barba, maestro del obispado, vino a ver la obra “(...) que hizo Miguel Ruiz, obrero de la Iglesia (...)”. Otros apuntes al respecto figuran en los años 1575, 1576 y 1577, estando en este último al frente de la maestría el cantero Juanes de Izpino o Azpino. En las cuentas de los años 1604-1610 hay constancia de una “... segunda obra de la capilla...”. Resulta difícil precisar en la actualidad los vestigios vandelvirianos conservados en dicha capilla mayor, ya que sufrió una importante intervención en siglo el XVII, amén de numerosas restauraciones posteriores.

En cualquier caso queda documentada su participación en el proceso constructivo de esta monumental iglesia gótica, cuyo inicio cabe situar bajo el mandato del prelado don Alonso Suárez de la Fuente el Sauce (1500.1520), cuyos escudos campean en la delicada portada plateresca abierta en el lado Este. Contigua a ella se alza una espléndida torre de campanas, con bella crestería plateresca, levantada en tiempos del obispo don Gabriel Esteban Merino (1523-1535). Digna de destacar es también la portada Oeste, labrada por mandato del obispo don Diego Tavera (1555-1560). No conserva el templo en su interior la original techumbre de madera, de la que tan solo queda una parte a nivel del coro. La importancia de esta iglesia para la ciudad de Baeza es debida, al margen de lo artístico, a que en ella se veneran los Patronos locales, San Andrés Apóstol y Nuestra Señora del Alcázar.

OTRAS MANIFESTACIONES ARTÍSTICAS NO ARQUITECTÓNICAS.

Preside la capilla mayor un bello retablo, que en opinión de la profesora Luz de Ulierte es “(...) uno de los mejor tallados, poli cromados y dorados de toda la diócesis, tanto su arquitectura como sus esculturas (...)”. Estilísticamente se inserta dentro del círculo de Sebastián de Solís y Gil Fernández, aunque realizado por los hermanos Blas y Juan de León, entre 1629 y 1633. El programa iconográfico está conformado por los doce Apóstoles, Cristo Crucificado con la Virgen y San Juan. En el camarín, la Virgen del Alcázar, patrona de la ciudad, es talla gótica, aunque reformada en el siglo XVIII. A los pies del templo son destacables la sillería de coro y un lienzo de la Divina Pastora en la capilla bautismal, piezas del siglo XVIII. Dieciochesca es también una bella Inmaculada Concepción. En la sacristía se conservan nueve tablas procedentes de un retablo de la desaparecida Colegiata, atribuidas al pintor Francisco Sánchez en las últimas décadas del siglo XV. En ellas se representan el Nacimiento, la Adoración de los Magos, la Circuncisión, la Presentación de Jesús en el templo, la última Cena, el Prendimiento, El Calvario, la Ascensión de Jesús y la Asunción de la Virgen.

Su portada que coincide con la nave central se eleva verticalmente con una puerta adintelada que va precedida de unas escalinatas, y, sobre ella, en el mismo eje, una estilizada ventana con arco de medio punto. Presenta también otra ventana circular resaltada igualmente respecto al muro, y, cerrando, en lo alto, la fachada principal, una pequeña cruz de piedra, que marca el eje central. La supera en altura la torre, de base cuadrada, situada a la derecha de nuestra vista, con tres cuerpos separados por dos cornisas y esquinas reforzadas, y en el campanario, grandes huecos con arcos de medio punto y tejas a cuatro aguas. Para visitar: horario de culto.