Elle présente un plan à nef unique avec des chapelles entre les contreforts, sans communication entre elles. La voûte de la nef centrale est une voûte en berceau, reposant sur des arcs doubleaux qui reposent eux-mêmes sur de belles pilastres. La chapelle majeure est précédée d'un grand arc où se distingue le blason de l'évêque Don Antonio Brizuela y Salamanca. Le presbytère est couvert d'une intéressante coupole pseudo-ovale sur pendentifs, réalisée au XVIIe siècle. Aux pieds de l'édifice se trouve le chœur, en hauteur, soutenu par deux colonnes, ainsi que le clocher. Le retable original du maître-autel, dont seul le corps de l'attique est conservé dans son intégralité, est une œuvre baroque, également exécutée dans la seconde moitié du XVIIe siècle, bien que dorée en 1737 par les maîtres Manuel Pancorbo et Antonio Clavijo. Il présente une structure à trois travées séparées par des colonnes salomoniques et un attique abritant l'image d'un Christ en croix. Cette église compte sept chapelles latérales traditionnellement liées à des familles. Pendant la guerre civile disparurent les retables d'origine et surtout la riche imagerie de ses autels. • Chapelle de San José • Chapelle de Nuestra Señora de los Dolores • Chapelle de San Antonio • Chapelle de María Auxiliadora • Chapelle des Âmes • Chapelle de la Veracruz • Chapelle du Señor de la Columna

Ce palais rural s'articulait en deux corps, le supérieur formant une galerie ouverte (solana) aux petites ouvertures asymétriques, et un corps inférieur d'accès, réalisé au moyen de grands arcs en plein cintre sur de simples pilastres se prolongeant verticalement jusqu'à l'étage supérieur. La sobriété de sa construction, ainsi que son austérité ornementale, montrent qu'il fut conçu non pas tant comme emblème de la grandeur et du pouvoir du seigneur de Torralba et de Torrequebradilla, mais comme palais résidentiel, avec pour fonction de maison de maître destinée à administrer les tâches agricoles et pastorales sur les champs et pâturages.

La vénération populaire du Christ titulaire est liée à une mortelle épidémie de peste qui ravagea la localité en 1833, jusqu'à ce que les habitants décident de porter l'image du Crucifié en procession, ce qui fit reculer l'épidémie et guérir les malades. En action de grâce, l'ermitage fut réaménagé, ses éléments d'intérêt étant le portail à arc en plein cintre en pierre de taille et le clocher-mur à un seul niveau, et l'on changea le vocable de son titulaire.

Vers le XVIIIe siècle fut construit l'ermitage de la Vierge d'Atocha sur les vestiges d'un cimetière. On ne connaît pas avec précision la date ni l'année de son apparition, mais celle-ci est liée à celle de la Vierge d'Atocha de Madrid, les deux se référant à la même Vierge. L'histoire remonte à un passé lointain, car la tradition orale raconte qu'un jour la grande Dame apparut à l'endroit où se trouve aujourd'hui son ermitage. Voyant qu'il s'agissait de la Vierge d'Atocha vénérée à Madrid, les habitants décidèrent de la ramener dans la capitale espagnole. Elle réapparut au même endroit, et on la ramena de nouveau à Madrid, et ainsi de suite, jusqu'à ce qu'on décide de la laisser ici, car elle semblait ne pas vouloir quitter Villardompardo — et c'est ainsi que fut construit son ermitage. Au fil des ans, tous les habitants de Villardompardo en vinrent à l'adorer et à lui vouer une grande foi.

Dans la zone où se situe le château ont été documentées des structures d'habitat et de stockage (une structure hydraulique, des silos et des fonds de cabanes) appartenant à un village de l'âge du Cuivre. De l'établissement romain, on peut distinguer une double enceinte fortifiée, protégée par un fossé du côté nord, qui renforçait sa défense. Elle s'articulait probablement autour d'une tour située au sud-ouest, à laquelle correspondraient les blocs de grande taille qui fondent le donjon médiéval. À l'intérieur s'élevaient des édifices dont il ne reste que peu de vestiges, avec des structures de stockage de production agricole et d'eau. La forteresse médiévale, érigée entre les XIIIe et XIVe siècles en profitant des vestiges d'époque romaine, consistait en une enceinte fortifiée en forme de trapèze irrégulier, dotée de quatre tours, dont trois sont aujourd'hui conservées : une grande tour rectangulaire occupant l'angle sud-ouest ; une petite tour circulaire au nord-ouest, dont seule la base subsiste ; et une autre rectangulaire, massive, au nord-est, qui défendait la porte du château. À l'angle sud-est existait une quatrième tour, disparue au XIXe siècle. L'ensemble est construit en maçonnerie, à l'exception du mur sud, dont l'élévation est en pisé. Le donjon sud-ouest, ou donjon proprement dit, se divise en trois étages plus un rez-de-chaussée, occupé par une citerne. En certains points du donjon, on peut encore distinguer des vestiges de la décoration d'origine qui couvrait les murs de la fortification, un motif de feuilles ou de gouttes obtenu par des techniques de sgraffite, décoration qui couvrait également les murailles et la tour massive. La porte d'origine de la tour était fortement défendue, à double vantail ; elle disposait d'une ouverture pour jeter des liquides ou des pierres sur les assaillants, ainsi que d'une herse. Cet accès fut condamné lors de la construction d'une citerne à l'intérieur de la tour, qui occupe presque tout le rez-de-chaussée. La couverture voûtée de la citerne a disparu, mais deux éléments qui y sont liés sont encore conservés : une structure de décantation et un puits pour l'extraction de l'eau. Les interventions archéologiques qui mirent au jour ce réservoir d'eau récupérèrent également l'escalier d'origine encastré dans le mur nord de la tour. Les deux peuvent être observés lors de la visite, la citerne pouvant être parcourue à pied. La montée au donjon culmine sur la terrasse, qui offre un vaste contrôle visuel du territoire, permettant d'apercevoir des sites tels qu'El Berrueco, Andújar, Arjona ou Martos, ce qui explique le choix de cet emplacement pour la construction de la fortification. Sa position sur un versant escarpé faisait office de défense naturelle, mais les côtés nord et ouest, plus accessibles, étaient protégés par un large fossé d'environ 7 m de largeur et 2,10 m de profondeur maximale, resté caché jusqu'à sa mise au jour lors de récentes interventions archéologiques. Le fossé s'étendait entre deux tours renforcées par des escarpes encore visibles. À partir du XVIe siècle s'ouvre une nouvelle porte dans la muraille ouest, avec un portail Renaissance encore conservé, réalisé en pierre de taille. Il se compose de deux corps, l'inférieur à arc en plein cintre sur pilastres, et le second avec un grand cartouche rectangulaire au centre, portant les armoiries de Don Fernando de Torres et de sa première épouse, Doña Francisca de Carvajal y Osorio. La plus grande transformation fut la construction de corps de bâtiment accolés aux murailles, formant un vaste espace résidentiel. Le donjon et le mur sud conservent des baies qui les auraient reliés entre eux. Aujourd'hui, on reconnaît les rez-de-chaussée de ces constructions, bien qu'elles aient atteint entre deux et trois étages de hauteur. Ces corps de bâtiment abritaient « l'espace privilégié » du palais, c'est-à-dire les appartements du comte et de la comtesse, la chapelle, la crypte, le vestibule et un corridor-galerie ou atrium, dans le corps ouest, tandis que dans l'édifice sud, le rez-de-chaussée était consacré au stockage, réservant le premier étage à l'espace représentatif principal du palais, une grande salle dotée d'une cheminée sculptée dans la façade de la tour. Les structures situées au nord et à l'est étaient principalement dédiées au service, incluant les écuries, les cuisines et une cave. Les interventions archéologiques confirmèrent l'existence d'un établissement préhistorique, de l'âge du Cuivre, sur la colline où se trouve aujourd'hui le château. La présence de dents de faucille, de meules et de silos de stockage indique une économie agricole basée sur la culture des céréales. Ont également été localisées une structure hydraulique, des structures d'habitat souterraines et des trous de poteau. Il ne semble pas y avoir eu de continuité dans l'occupation de l'espace, ce qui suppose un abandon temporaire de l'établissement. Du début du Ier siècle av. J.-C. jusqu'au IIe siècle apr. J.-C., on observe dans la campagne une augmentation des établissements agricoles consacrés à la culture des céréales. À cette époque se produit une réoccupation de cet espace, un établissement fortifié, dont l'apogée se situerait entre le premier quart du Ier siècle et le IIe siècle apr. J.-C., avant d'être à nouveau abandonné. Au bas Moyen Âge, le terme « villar » désignait un lieu portant les vestiges d'un établissement ancien abandonné. Après la conquête du territoire, les Castillans s'y établirent alors que les structures romaines étaient encore visibles, choisissant d'en réutiliser certaines, ainsi que des matériaux de construction, pour ériger le château. Le hameau d'El Villar de Don Pardo est déjà mentionné dans les sources en 1251, mais le château ne sera construit qu'à la fin du XIIIe ou au début du XIVe siècle, la fortification étant mentionnée pour la première fois en 1416, comme lieu appartenant encore au conseil municipal de Jaén. Par la suite, Fernando Ruiz de Torres obtiendra la cession du hameau. Dans la seconde moitié du XVe siècle, alors que Teresa de Torres, épouse du connétable de Castille Miguel Lucas de Iranzo, est dame du lieu, Villardompardo devient l'une des lignes de défense des partisans d'Henri IV face à la noblesse rebelle, dirigée dans la région par l'ordre de Calatrava. Le décès sans héritiers de son fils fit passer la seigneurie à une branche collatérale des Torres, alliée à la famille de Pierre Ier de Portugal. Philippe II en fit un chef-lieu de comté en nommant Don Fernando de Torres y Portugal comte de Villardompardo en 1576. Entre la fin du XVIe et le début du XVIIe siècle s'effectuera la transformation du château en palais, résidence habituelle des comtes. Leurs successeurs, cependant, installèrent leur résidence à la Cour, à Madrid, ce qui entraîna un processus de ruine, faute d'entretien. L'abolition des majorats sous le règne de Ferdinand VII obligea au partage de l'héritage, détachant le château de Villardompardo de la branche nobiliaire principale. À la fin du XIXe siècle ou au début du XXe, les bâtiments construits au XVIe siècle furent démolis, ne laissant que les murs périmétraux, aplanissant la surface et taillant des gradins dans la muraille nord pour transformer temporairement l'enceinte en arène de tauromachie. Le château a fait l'objet de divers travaux de consolidation d'urgence, de fouilles archéologiques et de restauration entre 2012 et 2023.